Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
D430041D05RikF6ZGR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
D430041D05RikF6ZGR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms