Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933403O08RikF6UK53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933403O08RikF6UK53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4933403O08RikF6UK53 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms