Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28305F6U473 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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