Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf212F6TQD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf212F6TQD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms