Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syngap1F6SEU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngap1F6SEU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms