Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plekhg1F6S200 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Plekhg1F6S200 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhg1F6S200 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhg1F6S200 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms