Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc7bE9Q9Y3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Ccdc7bE9Q9Y3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc7bE9Q9Y3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ccdc7bE9Q9Y3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ccdc7bE9Q9Y3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ccdc7bE9Q9Y3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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