Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp17lbE9Q9U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp17lbE9Q9U0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp17lbE9Q9U0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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