Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc146E9Q9F7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc146E9Q9F7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc146E9Q9F7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms