Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd35E9Q9D8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd35E9Q9D8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd35E9Q9D8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms