Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdhr2E9Q7P9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdhr2E9Q7P9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdhr2E9Q7P9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms