Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp31E9Q6Y8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp31E9Q6Y8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp31E9Q6Y8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms