Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc1E9Q5K9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ythdc1E9Q5K9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ythdc1E9Q5K9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms