Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn2r48E9Q5D8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn2r48E9Q5D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms