Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip11E9Q512 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trip11E9Q512 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms