Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71lE9Q4T4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms