Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tarbp1E9Q368 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tarbp1E9Q368 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tarbp1E9Q368 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms