Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4f2E9Q366 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f2E9Q366 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4f2E9Q366 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms