Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcom1E9PZ54 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcom1E9PZ54 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms