Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp54bE9PXC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp54bE9PXC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms