Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scgb1b20E9PWZ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scgb1b20E9PWZ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms