Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rsf1E9PWW9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rsf1E9PWW9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rsf1E9PWW9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Rsf1E9PWW9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms