Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4931408C20RikE9PWP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4931408C20RikE9PWP9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 303.1 ms