Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r1E9PVR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r1E9PVR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms