Protein–RNA interactions for Protein: E9PV85

Amy2a1, Amylase 2a1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy2a1E9PV85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amy2a1E9PV85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amy2a1E9PV85 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.5 ms