Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cngb1E1AZ71 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cngb1E1AZ71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms