Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5286E0CXI6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5286E0CXI6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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