Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
4930558K02RikE0CXC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930558K02RikE0CXC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms