Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21560D3Z7A4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21560D3Z7A4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms