Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930595D18RikD3Z642 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930595D18RikD3Z642 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms