Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6ap1lD3Z5W0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms