Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12cD3Z3L3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12cD3Z3L3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms