Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3676D3Z236 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3676D3Z236 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3676D3Z236 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3676D3Z236 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3676D3Z236 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3676D3Z236 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3676D3Z236 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms