Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930467E23RikD3Z1P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930467E23RikD3Z1P8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms