Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem200bD3Z0P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem200bD3Z0P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms