Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldlrad1D3YYZ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ldlrad1D3YYZ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms