Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif28pD3YXS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif28pD3YXS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms