Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd1D3YXK1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd1D3YXK1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms