Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo5D3YW29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo5D3YW29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo5D3YW29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms