Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30cD3YVI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30cD3YVI9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms