Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptprz1B9EKR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms