Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syce3B5KM66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce3B5KM66 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syce3B5KM66 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms