Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Phf11bB4XVQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Phf11bB4XVQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Phf11bB4XVQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Phf11bB4XVQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms