Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf11cB4XVP9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms