Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cspp1B2RX88 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cspp1B2RX88 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms