Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700018F24RikB2RW27 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700018F24RikB2RW27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms