Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hbb-bh2B2RVB7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms