Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrt4B2RU40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrt4B2RU40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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