Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H60cB1B213 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H60cB1B213 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H60cB1B213 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H60cB1B213 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H60cB1B213 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H60cB1B213 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H60cB1B213 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms