Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2012B1B0R1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2012B1B0R1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms